Rozpoczęcie segregacji odpadów na terenie gminy Nysa sięga roku 2000, kiedy to ze środków Gminnego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej zakupiono łącznie 33 pojemniki do selektywnej zbiórki baterii oraz 1 zbiorczego pojemnika typu KP7 przystosowanego do zbierania baterii. Zostały one rozstawione we wszystkich szkołach podstawowych na terenie miasta i gminy. Do roku 2007 zebrano ponad 1 tonę odpadów baterii.
W latach 2006 – 2008 rozpoczęto wdrażanie systemu selektywnej zbiórki odpadów komunalnych poprzez selektywną zbiórkę odpadów tworzyw sztucznych, papieru, szkła białego i kolorowego oraz baterii. W tym celu urząd zakupił i rozstawił do końca 2008 r. łącznie 312 pojemników, wydając na ten cel ponad 277 zł.
Pojemniki te zostały rozstawione na terenie gminy Nysa. Dodatkowo wszystkie placówki oświatowe podległe gminie wyposażono w specjalne 3 - komorowe zestawy pojemników przeznaczone do selektywnej zbiórki odpadów.
Nieodzownym elementem segregacji odpadów oprócz rozstawienia pojemników jest również selektywna zbiórka zbieranych odpadów. W ramach działań edukacyjnych burmistrz Nysy podjął decyzję o finansowaniu zbiórki tych odpadów ze środków Gminnego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej. Na ten cel w latach 2007-2008 wydano łącznie kwotę 194 319 zł.
Nie tylko urzędnicy podejmują działania związane z prowadzeniem selektywnej zbiorki odpadów. Również Spółka Gminna EKOM rozstawiła z własnych zasobów na terenie gminy w latach 2005 - 2008 łącznie 91 pojemników do selektywnej zbiórki, w tym 42 przeznaczone do zbierania szkła kolorowego oraz 49 do zbierania tworzyw i w całości finansuje koszty związane ze zbiórka selektywnie zebranych odpadów.
Łącznie Gmina Nysa dysponuje ponad 400 pojemnikami do selektywnej zbiórki odpadów. Od czasu rozpoczęcia selektywnej zbiórki zostały zebrane następujące ilość odpadów w tonach. W 2008 roku zebrano ich łącznie 409, w tym makulatura – 127, szkło – 220 i tworzywa sztuczne – 62.
Segregacja realizowana jest w oparciu o wydane odpowiednie akty prawne zarówno przez Radę Miejską w Nysie oraz burmistrza Nysy. Stanowią one prawo miejscowe, zobowiązujące przedsiębiorców świadczących usługi w zakresie odbierania odpadów komunalnych od właścicieli nieruchomości do udostępniania mieszkańcom i podmiotom pojemniki lub worki przeznaczone do selektywnej zbiórki odpadów.
Od roku 2007 w ramach działań mających na celu zapobieganie powstawania odpadów biodegradowalnych, udzielane są ze środków Gminnego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej dotacje w wysokości do 200 zł na zakup kompostownika dla osób fizycznych realizujących zadania związane z kompostowaniem odpadów organicznych w ogrodach przydomowych.
Dążąc do wyeliminowania składowania odpadów niebezpiecznych w sposób niekontrolowany opracowano i wdrożono system dotacji dla osób fizycznych na usuwanie odpadów niebezpiecznych zawierających azbest, pochodzących z demontażu materiałów budowlanych w postaci płyt azbestowo - cementowych płaskich i falistych stanowiących pokrycie dachowe i elewację budynków, ich transportem na składowisko odpadów niebezpiecznych. Wysokość dofinansowania wynosi do 1000 zł.
Przedsięwzięcia te nie wyczerpują wszystkich działań związanych z selektywną zbiórką odpadów. W roku 2008 Urząd Miejski przeprowadził objazdowe 2 akcje zbiórki odpadów niebezpiecznych. W ramach tych akcji wszyscy mieszkańcy gminy mieli możliwość pozbycia się w sposób legalny posiadanych w gospodarstwach domowych odpadów. Zebrano znaczne ilości świetlówek, telewizorów, olei lepiszcza, farb, rtęci i wielu innych.
Zapowiadany wzrost opłaty „tzw. marszałkowskiej” za składowanie odpadów na składowisku z 75 zł za tonę do 100 zł z 1 stycznia 2009r. spowodował, że pomimo wielu już podjętych działań związanych z selektywną zbiórką odpadów, należy w dalszym ciągu rozwijać działania związane z wdrażaniem selektywnej zbiórki odpadów.
W związku z powyższy z inicjatywy burmistrza Nysy, rada miejska uchwałą z dnia 26 września wprowadziła nowelizację Regulaminu utrzymania czystości i porządku na terenie Gminy Nysa, która przewiduje z dniem 1 stycznia m.in.: obligatoryjną selektywną zbiórkę odpadów z podziałem na papier, tworzywa, szkło biała, szkło kolorowe, obowiązek ustawiania pojemników oraz worków na odpady w granicach własnej nieruchomości, gromadzenie odpadów opakowaniowych w zabudowie niskiej przy użyciu zestawów indywidualnych pojemników lub worków – jest to tzw. zbiórka „u źródła”, selektywną zbiórkę odpadów biodegradowalnych po wybudowaniu kompostowni na składowisku w Domaszkowicach.
Ponadto Gminna Spółka EKOM przyjmuje nieodpłatnie w Zakładzie Higieny Komunalnej w Nysie przy ul. Piłsudskiego 61 przywiezione samodzielnie odpady zebrane selektywnie: papier, tworzywa, szkło, zużyty sprzęt elektryczny i elektroniczny i odpady wielkogabarytowe.